Muzeum Archeologiczne w Krakowie otrzymało dofinansowanie z Programu Fundusze Europejskie na Infrastrukturę, Klimat, Środowisko (FEnIKS) 2021-2027 na realizację projektu „Dawny klasztor – było więzienie – nowoczesne muzeum. Adaptacja zabytkowej siedziby Muzeum Archeologicznego w Krakowie do współczesnych standardów z okazji 175. rocznicy powstania instytucji”. 
Dzięki realizacji projektu Muzeum zyska nowe oblicze, dostosowane do współczesnych standardów, zarówno w zakresie przebudowy i rozbudowy budynku głównego, odbudowy zabytkowego ogrodu wraz z wirydarzem, jak i wzbogacenia oferty wystawienniczej oraz edukacyjno-kulturalnej.
Dzięki realizacji projektu FEnIKS Muzeum przejdzie kompleksową modernizację, obejmującą:
* przebudowę i rozbudowę budynku głównego,
* odbudowę historycznego ogrodu wraz z wirydarzem,
* rozwój nowoczesnej oferty wystawienniczej oraz przestrzeni edukacyjno-kulturalnej.
To przełomowy krok w kierunku uczynienia jednej z najstarszych instytucji muzealnych w Polsce nowoczesnym i otwartym miejscem dialogu z przeszłością – na miarę XXI wieku.
W 2025 roku Muzeum Archeologiczne w Krakowie świętuje 175-lecie swojego istnienia – to wyjątkowy jubileusz w historii naszej instytucji.